Der Kaisermarathon startet im Zentrum von Söll und führt als erstes über das Gasthaus Badhaus. Bei km 8 wird nocheinmal das Söller Dorf durchlaufen und im Anschluss geht es über den Schattseitweg in Richtung Gasthaus Bavaria. Weiter gehts über die Bergschenke hinauf an der Rübezahlalm vorbei zum Hartkaiser bis zur Tanzbodenalm über die Terrasse, weiter zum Jochstubensee, welcher über die Zinstalalmen umlaufen wird. Über den Filzalmsee gehts weiter zum Hexenwasser Hochsöll, hinauf zu den Innerkeatalmen. Die finale Umrundung der Hohen Salve führt zum abschließenden Anstieg von der Rigialm zum Ziel der Hohen Salve.